Під час ендоскопії лікар вводить в тіло людини інструмент, який має назву ендоскоп. Більшість ендоскопів – це тонкі трубки з потужною лампою та крихітною камерою на кінці. Довжина і гнучкість ендоскопа залежать від тієї частини тіла, яку лікар повинен оглянути. Прямий ендоскоп дозволяє оглядати суглоби, гнучкий – внутрішню частину товстої кишки.
Як правило, ендоскоп має канал, через який лікар може вводити у внутрішні порожнини пацієнта різні інструменти, щоб збирати зразки тканин і здійснювати інші маніпуляції. Здійснюючи ендоскопічне дослідження шлунку, лікар може використовувати й інше ендоскопічне обладнання:
- гнучкі щипці – для збору зразків тканин;
- щипці для біопсії – для видалення зразків тканин і небажаних утворень;
- цитологічні щітки – для збору зразків клітин;
- щипці для зняття швів – для зняття швів у внутрішніх порожнинах.