
Опитування, проведене у 1991 році, виявило три основні джерела аналітичних помилок: 
- обробка зразків (22,6%) 
- помилки оператора (17,1%) 
- забруднення (14,6%) 
Разом ці чинники становили понад половину (54,3%) усіх помилок у аналітичному процесі, причому більшість із них пов’язана з етапом підготовки зразка. Це підтверджує, що підготовка зразка — не лише найбільш трудомісткий, але й один із найкритичніших етапів аналізу. Для підготовки використовують розчинники, дериватизатори та інші хімічні речовини, що підвищує ризик випадкового внесення забруднень. Через три десятиліття ці самі джерела помилок залишаються актуальними. Однак на даний момент найбільший внесок у виникнення аналітичних помилок робить не підготовка, а калібрування. Водночас спостерігається позитивна динаміка: за останнє покоління частка помилок при обробці зразків зменшилася майже вдвічі. Це, ймовірно, пов’язано з більшим фокусом на якісну підготовку зразків, розвитком ефективніших методів і ширшим впровадженням автоматизації (докладніше про це в наступній частині статті). Збільшення автоматизації також може сприяти зменшенню людського фактора в аналітичному процесі. Найбільше занепокоєння сьогодні викликає ризик контамінації зразків, зважаючи на активне використання розчинників у більшості схем підготовки. Розчинники досі залишаються потенційними джерелами забруднень. Історично підготовка зразків вирізнялася високою вартістю, значною тривалістю, трудомісткістю та проблемами з відтворюваністю результатів. Також були поширені скарги на нестачу інформації про зразки, їхнє погане повернення та забруднення. У 2024 році основними проблемами, за результатами нового опитування, стали: 
- погане повернення зразків 
- недостатня відтворюваність результатів  
- складність їх інтерпретації 
Дещо менше респонденти відзначали високу вартість, трудомісткість, часові витрати та брак інформації про зразки. Цікаво, що за останнє десятиліття використання ручної праці та часу значно зменшилося — з 60,8% у 2013 році до 23,8% у 2023-му. Це може свідчити про поступ у впровадженні сучасних методів підготовки зразків. Водночас частка респондентів, які вказали на вартість (29,3% у 2013 р. проти 26,8% у 2023 р.), брак знань про зразок (22,7% проти 22,5%) та забруднення (12,4% проти 13,8%), практично не змінилася. Натомість помітно зросла кількість скарг на погане повернення зразків (з 27,6% до 37,6%) та недостатню відтворюваність (з 24,0% до 30,9%). Це може бути пов’язано з переходом до менших обсягів зразків або ускладненням їхніх матриць.