Сучасне програмне забезпечення з використанням ШІ полегшує аналіз зображень та прискорює отримання інформації для дослідників
Aivia — це інноваційна повноцінна платформа для візуалізації, аналізу та інтерпретації 2D – 5D зображень в мікроскопії. Використовуючи передовий алгоритм та програмну архітектуру, Aivia забезпечує високу продуктивність у критично важливих завданнях, таких як відображення великих зображень та аналіз складних біологічних явищ.
Aivia використовує низку технологій машинного навчання для сегментації зображень, класифікації об’єктів та виявлення зон інтересу у зразках. Використовуючи Aivia, біологи можуть легко отримувати інформацію з великих та складних зображень за лічені хвилини. Aivia можна використовувати як локально, так і на хмарному ресурсі.
Конфокальна мікроскопія на платформі STELLARIS Leica є передовою технологією для високоякісної візуалізації біологічних зразків з використанням білого лазерного світла, акустично-оптичного подільника світлових променів та детекторів Power HyD. Ця система дозволяє виконувати пошарове сканування для відтворення тривимірної моделі зразків одночасно у декількох емісійних діапазонах з динамікою в часі. Однак обробка та аналіз терабайтів даних ускладнює робочий процес. В інтеграції Aivia з платформою STELLARIS від Leica Microsystems відкриваються нові горизонти в дослідженні зображень у біомедичних дослідженнях. Інтеграція Aivia зі STELLARIS забезпечує автономну мікроскопію та аналіз зображень з 3D скануванням зон інтересу.
Виявлення та аналіз рідкісних подій у біологічних зразках є актуальним у таких галузях досліджень, як рак та хвороба Альцгеймера. На зображенні показано мітоз, виявлений за допомогою автономної мікроскопії на базі Aivia.
Отримуйте високоякісний результат швидше за допомогою автономної мікроскопії на базі Aivia:
- робочий процес виявлення нетипових структур у біологічних зразках, заснований на штучному інтелекті для природничих наук у STELLARIS, самостійно виявляє до 90 % аномальних особливостей. Це дозволяє скоротити час рутинної роботи за мікроскопом;
- скорочений час збору даних до 70 %, адже ідентифікуються та реєструються лише цікавлячі вас об’єкти. Записуйте лише те, що потрібно, раціонально використовуючи місце на диску;
- проводьте експерименти, які раніше були недоступні через обмеження у часі та складність, за допомогою автономної мікроскопії на базі Aivia.
Aivia інтегрується зі STELLARIS через LAS X Navigator та Image Compass – інтерфейси для налаштування експериментів. Програмне забезпечення підтримує імпорт даних з більш ніж 45 форматів файлів у мікроскопії, включаючи конфокальні файли STELLARIS, з використанням локальних або віддалених ресурсів (Aivia Web).
Процес виявлення аномальних особливостей у біологічних зразках базується на взаємодії двох компонентів, доступних у конфокальній системі STELLARIS. Зазвичай аналізуються загальні сканування біологічного зразка. Якщо Aivia виявляє ознаки аномалії, позиції повертаються назад до керуючої програми STELLARIS Navigator Expert. Положення виявлених зон інтересу автоматично скануються з високою роздільністю та у трьох вимірах на основі визначених користувачем налаштувань.
Результати сегментації за прикладом. 48-канальне зображення каналу товстої кишки людини, отримане за допомогою системи Leica Cell DIVE, проаналізоване за допомогою Aivia Segment by Example та забарвлене за допомогою вимірювань округлості.
Leica Microsystems нещодавно випустила оновлення свого програмного забезпечення для аналізу зображень на основі штучного інтелекту. Тепер Aivia 15 дозволяє вченим швидко налаштувати систему, розширити інтуїтивний аналіз на основі AI для точного виявлення зон інтересу, а потім легко здійснити пакетну обробку результатів аналізу.
Комфорт використання є ключовим фактором останньої версії Aivia за рахунок нових інструментів, таких як Segment by Example, який дає змогу користувачам малювати безпосередньо на 2D‑ або 3D‑зразках клітин для розгортання моделі штучного інтелекту, модифікованої з Cellpose. Цей підхід глибокого навчання забезпечує точну сегментацію різних клітинних морфологій, використовуючи лише кілька прикладів, що дозволяє будь‑якому науковцю швидко отримувати потрібні дані без необхідності програмування чи навчання власних моделей.
Удосконалена 3D‑обробка дає результати до 69 % швидше, оптимізуючи навіть найскладніші задачі тривимірного аналізу. Новий інструмент Workflow Creator полегшує налаштування пакетної обробки для сегментації, класифікації та аналізу просторових зв’язків, а оновлений інструмент Spatial Relations дозволяє отримувати об’єктно-орієнтовні просторові дані, включно з метриками локалізації та сусідніх об’єктів.
Aivia 15 доступна завдяки гнучким моделям ліцензування, які надають користувачам варіанти реалізації їх конкретних лабораторних вимог. Існуючі користувачі Aivia з активною підтримкою та оновленням можуть отримати доступ до Aivia 15 для плавного переходу до цього оновлення.
